Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms