Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC41PQ6P2S7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms