Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H3F3CQ6NXT2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms