Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIRMAQ69YN4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms