Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf84Q5VXU9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms