Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CHIC1Q5VXU3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms