Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms