Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VSD8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms