Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LDLRAP1Q5SW96 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LDLRAP1Q5SW96 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms