Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP188Q5SRE5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms