Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FRMPD3Q5JV73 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FRMPD3Q5JV73 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FRMPD3Q5JV73 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FRMPD3Q5JV73 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FRMPD3Q5JV73 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD3Q5JV73 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms