Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSP90AB3PQ58FF7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSP90AB3PQ58FF7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms