Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALFQ53S48 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms