Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRY2Q49AN0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRY2Q49AN0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms