Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC153Q494R4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms