Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KNOP1Q1ED39 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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