Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDB1Q16531 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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