Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA6Q16445 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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