Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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