Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTF1Q15361 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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