Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK3Q15120 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms