Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDCD1Q15116 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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