Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD6Q15008 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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