Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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