Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PICALMQ13492 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PICALMQ13492 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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