Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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