Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN2AQ12879 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
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