Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FOXO1Q12778 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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