Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC8Q09428 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC8Q09428 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC8Q09428 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ABCC8Q09428 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC8Q09428 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC8Q09428 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms