Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms