Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN7AQ01118 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms