Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms