Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RELNP78509 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RELNP78509 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RELNP78509 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RELNP78509 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms