Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB11AP62491 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms