Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHBDL3P58872 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms