Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCBP4P57723 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCBP4P57723 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms