Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP153P49790 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP153P49790 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP153P49790 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP153P49790 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUP153P49790 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUP153P49790 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUP153P49790 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms