Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms