Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGB2P26583 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms