Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NF1P21359 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NF1P21359 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NF1P21359 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NF1P21359 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms