Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI3P10071 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI3P10071 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI3P10071 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI3P10071 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms