Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC172P0C7W6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms