Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSP90AB1P08238 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms