Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms