Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX7O95931 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX7O95931 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBX7O95931 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms