Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN9O95484 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN9O95484 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms