Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALX3O95076 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALX3O95076 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALX3O95076 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALX3O95076 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALX3O95076 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms