Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCF11O94913 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCF11O94913 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCF11O94913 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCF11O94913 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCF11O94913 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCF11O94913 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms