Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFL1O94874 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
UFL1O94874 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFL1O94874 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFL1O94874 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms