Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ECM2O94769 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms